投稿日:2022年8月7日2022年8月10日バイオインフォ ggtreeで外部情報のついた系統樹を書く 投稿者 まじめちゃんggtreeで外部情報のついた系統樹を書くにコメント 系統樹を書く必要が出てきたので練習します！ 1. まずは系統樹そのものを書いてみる Netwik形式… 続きを読む
投稿日:2022年4月9日2022年4月9日バイオインフォ MGnify FTPからデータをダウンロードする 投稿者 まじめちゃんMGnify FTPからデータをダウンロードするにコメント ①wgetを使う MGnifyに登録されているデータをダウンロードするには、MGnifyのFTPサー… 続きを読む
投稿日:2022年3月19日2022年3月19日バイオインフォ, メタゲノム NCBIデータベースからSRAデータをダウンロードする 投稿者 まじめちゃんNCBIデータベースからSRAデータをダウンロードするにコメント バイオインフォ勉強中のまじめちゃんです。今日はNCBIデータベースからメタゲノムやトランスクリプトー… 続きを読む
投稿日:2022年3月13日2022年3月19日バイオインフォ, メタゲノム メタゲノム解析：公共データベース 投稿者 まじめちゃんメタゲノム解析：公共データベースにコメント バイオインフォ初心者まじめちゃんです！解析してみたいデータのひとつがメタゲノムですが、今のところ自分… 続きを読む
投稿日:2022年3月9日2022年3月19日バイオインフォ, バイオインフォマティクス Pythonによる実践レシピ Chapter 2.4 FASTQフォーマットの利用 投稿者 まじめちゃんChapter 2.4 FASTQフォーマットの利用にコメント 当記事は・・・ 参考書「バイオインフォマティクス Pythonによる実践レシピ」を勉強中の初心者まじ… 続きを読む
投稿日:2022年3月7日2022年3月19日バイオインフォ, バイオインフォマティクス Pythonによる実践レシピ Chapter 2.3 基本的な配列解析法 投稿者 まじめちゃんChapter 2.3 基本的な配列解析法にコメント 当記事は・・・ 参考書「バイオインフォマティクス Pythonによる実践レシピ」を勉強中の初心者まじ… 続きを読む
投稿日:2022年3月6日2022年3月19日バイオインフォ, バイオインフォマティクス Pythonによる実践レシピ Chapter 2.2 Genbankへのアクセス方法とNCBIデータベースの利用法 投稿者 まじめちゃんChapter 2.2 Genbankへのアクセス方法とNCBIデータベースの利用法にコメント 当記事は・・・ 参考書「バイオインフォマティクス Pythonによる実践レシピ」を勉強中の初心者まじ… 続きを読む
投稿日:2022年3月4日2022年3月19日バイオインフォ, バイオインフォマティクス Pythonによる実践レシピ Chapter1 Pythonとソフトウェア環境 投稿者 まじめちゃんChapter1 Pythonとソフトウェア環境にコメント 当記事は・・・ 参考書「バイオインフォマティクス Pythonによる実践レシピ」を勉強中の初心者まじ… 続きを読む
投稿日:2022年2月28日2022年3月19日バイオインフォ, 未分類 Entrezで特定の遺伝子をもつ生物をリストアップする 投稿者 まじめちゃんEntrezで特定の遺伝子をもつ生物をリストアップするにコメント Biopythonを使って何か試してみたい、バイオインフォ初心者のまじめちゃんです。 調べてる遺伝子… 続きを読む
投稿日:2022年2月12日2022年3月3日バイオインフォマティクス Pythonによる実践レシピ Chapter 3.7 Enzemblを用いた遺伝子オントロジーの抽出 投稿者 まじめちゃんChapter 3.7 Enzemblを用いた遺伝子オントロジーの抽出にコメント 当記事は・・・ 参考書「バイオインフォマティクス Pythonによる実践レシピ」を勉強中の初心者まじ… 続きを読む