投稿日:2022年8月7日2022年8月10日バイオインフォ ggtreeで外部情報のついた系統樹を書く 投稿者 まじめちゃんggtreeで外部情報のついた系統樹を書くにコメント 系統樹を書く必要が出てきたので練習します！ 1. まずは系統樹そのものを書いてみる Netwik形式… 続きを読む
投稿日:2022年8月2日2022年8月2日腸内細菌論文 39 サンゴの菌叢はサンゴの形態によって変化する 投稿者 まじめちゃん39 サンゴの菌叢はサンゴの形態によって変化するにコメント ジャーナル Microbiome からです。サンゴ礁はたくさんの微生物が住んでいることで有名ですが、… 続きを読む
投稿日:2022年8月2日2022年8月2日未分類 38 食物繊維が腸内細菌の応答性に関連する 投稿者 まじめちゃん38 食物繊維が腸内細菌の応答性に関連するにコメント 最近ジャーナル Micorbiomeの論文をよく見るので、数報同ジャーナルからまとめ読みしてみようと… 続きを読む
投稿日:2022年4月9日2022年4月9日バイオインフォ MGnify FTPからデータをダウンロードする 投稿者 まじめちゃんMGnify FTPからデータをダウンロードするにコメント ①wgetを使う MGnifyに登録されているデータをダウンロードするには、MGnifyのFTPサー… 続きを読む
投稿日:2022年4月8日2022年4月8日ろんぶん 37 Th17細胞を調節する腸内細菌 (Nature, 2022年3月) 投稿者 まじめちゃん37 Th17細胞を調節する腸内細菌 (Nature, 2022年3月)にコメント 今回はNature誌からヘルパーT17細胞の分化を阻害する腸内細菌代謝物の話です。 最近まじめちゃん… 続きを読む
投稿日:2022年4月4日2022年4月3日ろんぶん 36 海洋の栄養状態をメタゲノムで調べる (Science, 2021年4月) 投稿者 まじめちゃん36 海洋の栄養状態をメタゲノムで調べる (Science, 2021年4月)にコメント 海洋全域の栄養ストレスパターンをゲノム明らかにするというなかなか壮大なテーマです。しかも、どうやら植… 続きを読む
投稿日:2022年4月3日2022年4月3日ろんぶん 35 野生動物の腸内細菌 (Science, 2021年3月) 投稿者 まじめちゃん35 野生動物の腸内細菌 (Science, 2021年3月)にコメント 題名のとおり、本日はサイエンス誌からで野生動物の腸内細菌を調べた研究になります。 マイクロバイオーム… 続きを読む
投稿日:2022年3月28日2022年3月27日ろんぶん 34 哺乳類のがんリスク (Nature, 2022年12月) 投稿者 まじめちゃん34 哺乳類のがんリスク (Nature, 2022年12月)にコメント 今日はがんの論文を読んでみます。 Nature誌からで哺乳類におけるがんリスクの違いを調べた論文です… 続きを読む
投稿日:2022年3月27日2022年3月26日ろんぶん 33 腸内細菌で双極性うつを診断できるか！？ 投稿者 まじめちゃん33 腸内細菌で双極性うつを診断できるか！？にコメント 今回も腸内細菌の論文です！ うつと腸内細菌の関係は様々な研究で議論されていますが、「腸内細菌が本当に… 続きを読む
投稿日:2022年3月26日2022年3月26日ろんぶん 32 乳酸菌Lactobacillus acidophilusが認知能力を増強する 投稿者 まじめちゃん32 乳酸菌Lactobacillus acidophilusが認知能力を増強するにコメント よく聞くgut-brain axisに関する最新研究が出ていました。今回の論文によるとLactoba… 続きを読む
